بازسازی شبکههای ژنی دخیل در پاسخ به تنش خشکی درگیاه جو
Authors
Abstract:
سابقه و هدف: با توجه به اهمیت تنش خشکی و نظر به اینکه تحمل به تنش خشکی صفتی چند ژنی میباشد، هدف پژوهش حاضر بازسازی شبکه ژنی درگیر و شناسایی ژنهای کلیدی دخیل در تنش خشکی درگیاه جو با استفاده از تجزیه و تحلیل دادههای ریزآرایه و همچنین شناسایی فرایندهای موثر بوده است. مواد و روشها: تمامی ژنهای دارای بیان افتراقی (≤ 5/2 و≥ 5/2-) در بین تمامی آزمایشات ریزآرایه انجام شده ، با استفاده از نرمافزار Genevestigator شناسایی شدند. ترسیم شبکه برهمکنش پروتئینی و شناسایی ژنهای کلیدی با استفاده از نرمافزار Cytoscape و بررسی هستی شناسی ژنها بوسیله نرم افزار AgriGO صورت گرفت. یافته ها: نتایج بدست آمده از بازسازی شبکه برهمکنش پروتئینی منجر به شناسایی 14 و 15 ژن کلیدی دخیل در تنش خشکی به ترتیب در مرحله نموی رویشی و زایشی شد. بحث: براساس نتایج بدست آمده، از موثرترین ژنهای کلیدی دخیل در تحمل به تنش خشکی میتوان به ژنهای عوامل رونویسی ARF1، ABF3، DREB1A، DREB2A،HY5 و HYHاشاره کرد. نتیجه گیری: بررسی هستی شناسی ژنهای پاسخدهنده به خشکی و هاب روشن ساخت که تنظیم فرایندهای زیستی، فرایندهای متابولیسمی، کنترل دوره نوری و فتوسنتز و همچنین تنظیم زمان گلدهی از مهمترین فرآیندهای تاثیر گذار بر این تنش میباشند.
similar resources
بازسازی شبکههای ژنی و برهم کنش پروتئینی دخیل در پاسخ به تنش خشکی در برنج
برنج یکی از ارزشمندترین محصولات کشاورزی است. یکی از تأثیرگذارترین عوامل محدود کننده این محصول استراتژیک تنش خشکی میباشد. نظر به چند ژنی بودن تحمل به خشکی، هدف پژوهش حاضر بازسازی شبکه ژنی درگیر و شناسایی ژنهای کلیدی مربوطه در برنج با استفاده از تجزیه و تحلیل دادههای ریزآرایه بوده است. به همین منظور با استفاده از نرمافزار تحت وب Genevestigator تمامی ژنهای دارای تغییر بیان بالاتر و مساوی 5/2 ...
full textبازسازی شبکههای ژنی و برهم کنش پروتئینی دخیل در پاسخ به تنش خشکی در برنج
برنج یکی از ارزشمندترین محصولات کشاورزی است. یکی از تأثیرگذارترین عوامل محدود کننده این محصول استراتژیک تنش خشکی میباشد. نظر به چند ژنی بودن تحمل به خشکی، هدف پژوهش حاضر بازسازی شبکه ژنی درگیر و شناسایی ژنهای کلیدی مربوطه در برنج با استفاده از تجزیه و تحلیل دادههای ریزآرایه بوده است. به همین منظور با استفاده از نرمافزار تحت وب Genevestigator تمامی ژنهای دارای تغییر بیان بالاتر و مساوی 5/2 ...
full textتحلیل فیلوژنتیکی خانواده ژنی NAC در سورگوم دانهای و بررسی الگوی بیانی اعضای دخیل در پاسخ به تنش خشکی
سورگوم علیرغم تحمل قابلتوجه به خشکی، در دوران قبل و بعد از گلدهی در صورت مواجهه با تنش خشکی، دچار کاهش عملکرد دانهای میشود. عوامل رونویسیNAC ، نقش کلیدی در سازگاری سورگوم به خشکی ایفا میکنند. در این مطالعه، اطلاعات مربوط به خانواده پروتئینیNAC از پایگاههای اطلاعاتی جمعآوری شد. سپس، مدل مخفی مارکوف دمین NAC (PF02365) بر علیه پروتئینهای سورگوم مورد جستجو قرار گرفت. در مجموع، 183 توالی پر...
full textتحلیل فیلوژنتیکی خانواده ژنی NAC در سورگوم دانهای و بررسی الگوی بیانی اعضای دخیل در پاسخ به تنش خشکی
سورگوم علیرغم تحمل قابلتوجه به خشکی، در دوران قبل و بعد از گلدهی در صورت مواجهه با تنش خشکی، دچار کاهش عملکرد دانهای میشود. عوامل رونویسیNAC ، نقش کلیدی در سازگاری سورگوم به خشکی ایفا میکنند. در این مطالعه، اطلاعات مربوط به خانواده پروتئینیNAC از پایگاههای اطلاعاتی جمعآوری شد. سپس، مدل مخفی مارکوف دمین NAC (PF02365) بر علیه پروتئینهای سورگوم مورد جستجو قرار گرفت. در مجموع، 183 توالی پر...
full textنقش ساختار ریشه و صفات فیزیولوژیک جو در پاسخ به تنش خشکی
تنش خشکی در اکثر مناطق جهان مهمترین عامل کاهش عملکرد گیاهان زراعی محسوب میشود. تنظیم اسمزی و داشتن سیستم ریشهای قوی و عمیق از طریق افزایش جذب و بازده مصرف آب، سبب افزایش تحمل به خشکی در غلات میشود. در این تحقیق، تأثیر ساختار ریشه و صفات فیزیولوژیک در پاسخ به تنش خشکی در سه رقم جو زراعی یوسف (متحمل)، موروکو (حساس) و فجر30 (نیمهمتحمل) و یک اکوتیپ جو غیرزراعی اسپانتانئوم (متحمل) بررسی شد. بذ...
full textبررسی بیان ژن های دخیل در مسیر بیوسنتزی گلیکوزیدهای استویولی در پاسخ به شرایط تنش خشکی
چکیده: دیابت یکی از شایعترین و مهمترین بیماریهای مشاهده شده در طب بالینی است. برطبق آمارهای بدست آمده از سازما ن بهداشت جهانی، شیوع وگسترش دیابت درسال 2025 به 35 درصد افزایش میا بد. تعدادی داروی هیپوگلیسمی خوراکی وجود دارد. این داروها موثرند، اما دارای اثرات جانبی مضری می باشند. افزایش تقاضا برای استفاده از گیاهان دارویی برای درمان بیماری دیابت،به علت اثرات جانبی دارو های شیمیایی مانند انسول...
My Resources
Journal title
volume 8 issue None
pages 39- 48
publication date 2018-01
By following a journal you will be notified via email when a new issue of this journal is published.
No Keywords
Hosted on Doprax cloud platform doprax.com
copyright © 2015-2023